儀器簡介:
高通量組織研磨機
SPEX GENO 2010 GRINDER®高通量組織研磨機是杜邦先鋒公司專門為農業植物樣品合分子生物學方面研究而研發的一款新型高通量組織研磨機。通量接近400,可一次同時研磨384 個樣品,因而特別適用于植物和動物組織中核酸、蛋白質和其它成分的提取。研磨樣品包括植物的根、莖、葉、花、果、種子和某些動物組織;另外它還可以對酵母、培養的動物細胞、細菌細胞等進行破碎,從而提取其中的組分。
由于采用了無二的垂直上下震動模式,GENO 2010研磨的樣品具有研磨更加充分、更均勻、樣品重復性更好、樣品之間沒有交叉污染等優點,是真正的高通量組織研磨機。
植物組織核酸提取
為了從完整種子中分離核酸,需要先用機械粉碎的方法破碎種子,再提取和純化核酸。通常的機械破碎方法是人工采用研缽和杵進行研磨的方式;但是,這種方法并不適合高通量的種子破碎,因為人工研磨速度很慢而且研缽和杵的重復使用也容易導致交叉污染。用GENO對微孔板中的種子進行機械研磨,可以同時使核酸從大量種子細胞中釋放出來;再用傳統的分離方法就可以從勻漿液中純化出核酸。用水浸泡過夜的大豆可在3分鐘內高效一致地被均質化,所得漿液可以作為DNA分析的材料來源。
從培養的細胞中快速提取基因組DNA為PCR分析做準備
在科學家的研究和診斷過程中,PCR大大提高了對核酸進行檢測和定量測序的效率。但是,因為PCR方法通常需要在模板擴增前有一個純化步驟,因此這個過程并不快。純化步驟包括細胞收集和核酸的溶解,接下來還要用層析樹脂把核酸從裂解液中分離出來。雖然這些純化方法已經很大的發展,但是它們仍然需要耗費大量時間;而且,大量重復的試驗可能會耗費大量昂貴的材料。
GENO技術能夠一次快速而低成本地破碎大量培養的細胞,從而為后期對基因組DNA進行PCR分析而做準備。用GENO對微孔板中大量的培養細胞進行高通量均質化,再通過層析樹脂對核酸進行純化,并進行PCR分析,能大大提高基因組分析的效率。
酵母的96孔高通量破碎
多年的生物化學、基因組學和分子生物學研究取得的豐富信息表明,酵母已經成為生物系統研究的模式型和生物系統研究的模式生物和生物藥學家的有力工具。酵母已成為基因表達研究和蛋白質重組表達的通用宿主,包括Picbia、Hansenula、Debaryomyces均被研究者所使用,但使用的仍然是Saccbatomyces酵母。
酵母mRNA和細胞內蛋白通常很難用傳統的酶解方法從細胞中完整地提取出來。裂解酶中通常含有核糖核酸酶和其他蛋白,它們不僅會攻擊細胞壁,而且會攻擊特定的分子。並且,由酶解產生的原生質體通常需要借助一定的試劑進行溶解而導致很多蛋白貭變性失活。因此,通常需要采用機械的方式破碎酵母細胞從而釋放其內溶物。
機械破碎酵母傳統上採用壓榨機或球磨機。這兩種方法中都是單樣品操作的。對那些需要大量酵母克隆在一個高通量篩選環境中的檢測實驗來說,單樣品操作是個瓶頸並且是不切實際的。因此,需要一種方法可以高通量的機械分裂細胞。GENO一開始為深孔版中破碎種子而設計的球磨機,現在被用來在微孔版中對酵母進行破碎。
細菌細胞的裂解(嗜鹽菌和桿菌)
GENO能通過機械碰撞的方式裂解細菌細胞。以格蘭氏陰性耐鹽菌Halomonas elongate和格蘭氏陽性桿菌為模式研究對象,SPEX已經發展了相應的兩種技術:細菌培養,收獲并沖洗掉多余的培養基,將細胞懸浮于微孔版中的鹽水溶液中,在研磨界質存在的情況下用GENO對細胞進行震蕩破碎,6-9分鐘就能夠釋放足夠量的核酸,進行后續試驗。
應用領域
分子標記輔助育種、基因組學、系統生物學核分子進化、轉機因研究及其他生化研究領域。美國藥物食品管理局USFDA及環保署USEPA采用GENO作為殘留農藥測試或有毒物質樣品前處理,效率增加3-5倍,通量速率增加3-5倍,準確性以及在現性大幅提高。
技術參數:
1. 設備尺寸:15 in.(38.1 cm)x20.49 in.(52 cm)x25.25 in. (64.1 cm)
2. 重量:60 1bs.(27.24kg)
3. 功率:1/3馬力
4. 電源線:230V/50Hz兩相
5. 夾具行程:3.2cm(垂直)
6. 夾具速率:500-1750次/分鐘可調
7. 安全特征:兩道安全鎖、開蓋停止運作,兩程密封夾
8. 定時器:數字顯示為分:秒,值為5:00
主要特點:
• 杜邦旗下先鋒良種與SPEX共同開發設計,為專門為農業植物樣品而研發的一款新型高通量組織研磨機
• 是提取植物樣品中核酸,蛋白質其分析成分的經過特殊設計的研磨機
• 高通量:使用大夾具(2199)可同時研磨至384個樣品,并可適用于多種尺寸樣品的研磨,極大提高了工作效率
• 為了保證樣品的重現性、有效性、可比性,研磨機可設置時間、速率和循環次數,保證每次研磨和下一次研磨條件的一致性,時間3分鐘,速率1500 rpm。
• 有安全鎖裝置,一個充氣的氣缸鎖使蓋子穩固,用起來十分安全。
• 常溫、低溫動植物樣研磨專家
樣品容器
雖然GENO的夾具是為夾住兩個標準的深孔板而設計的,但是它也能適合于具有相同尺寸(5inchx3inchx2inch)的任何東西。這包括具有更少或更多樣品孔的深孔板、固定多個獨立小瓶的支架、和其它可能的構件。另外,夾具也能適用于高度在2.25inch內的不同樣品容器。
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