目前,微型模式動物、模式植物種子、大體積細胞及微球的分選在生命科學(xué)研究中有著非常廣泛的應(yīng)用,但是由于這些研究對象體積太大,普通流式細胞儀難以對其進行分選,而人工手動在顯微鏡鏡下分選耗時耗力、效率低下、準(zhǔn)確性難以保證,因此一種自動化大體積微粒分選系統(tǒng)應(yīng)運而生,它就是COPAS蠕蟲/胚胎流式分選系統(tǒng)/多參數(shù)生物微粒分析與分選系統(tǒng)。
COPAS大顆粒流式分選系統(tǒng)可以檢測微粒的尺寸、光密度及熒光信號,并根據(jù)用戶設(shè)定的域值,將相應(yīng)的微粒移入96孔板或其它容器中,*的技術(shù)使得整個過程對于微粒的生物活性不會產(chǎn)生任何負(fù)面影響。
COPAS系統(tǒng)基于流式細胞技術(shù)的深度開發(fā),與傳統(tǒng)流式細胞儀相比,有兩個重要改進:
*,系統(tǒng)管路直徑增大,以適應(yīng)20-1500um大小的生物微粒分選;
第二,采用的氣流動態(tài)分選技術(shù),保證收集到的生物活體的活性和完整性;
與傳統(tǒng)流式細胞儀相比:
| 傳統(tǒng)流式細胞儀 | COPAS* |
分選/分選參數(shù) | 前向角(FSC) | TOF(Time Of Flight)飛行時間 |
側(cè)向角(SSC) | EXT (Extinction) |
熒光參數(shù) | 熒光參數(shù) |
分選樣本大小 | 1-100um | 20-1500um |
分選方式 | 電磁場 | 空氣動力 |
分選壓力 | 12 – 60 PSI | 2 – 5 PSI |
產(chǎn)品特點:
l **能夠分選10-1500um生物微粒的自動化高通量分選系統(tǒng)
l 模式動物、模式植物種子與花粉、大體積細胞與細胞簇、微球/顆粒、高通量藥物分選
l 同時檢測微粒的五種光學(xué)參數(shù):微粒的尺寸、光密度及三色熒光信號
l 氣動分選技術(shù),保證收集到的生物活體或敏感化學(xué)物質(zhì)的活性和完整性,整個過程對微粒的生物活性不會產(chǎn)生任何負(fù)面影響
l 篩選速度達到每小時100,000個化合物,同時大大節(jié)省樣品的消耗量
l 全自動、高通量、高精度篩選,適用于大規(guī)模篩選
應(yīng)用領(lǐng)域:
COPAS大顆粒流式分選系統(tǒng)被廣泛應(yīng)用在模式動植物研究、大體積細胞研究及藥物篩選等方面,具體應(yīng)用對像包括微型模式動物:C .elegans、D .melanogaster、Zebrafish、Medaka, Mosquito, Xenopus;模式植物種子與花粉:Arabidopsis、花粉;大體積細胞與細胞簇:胚胎干細胞、胰島;微球/顆粒:化合物結(jié)合微球、微球分析。
1.蠕蟲發(fā)育表達譜
對單一基因來說,其在發(fā)育過程中表達的變化可依據(jù)其表達量來說明,什么時候表達開始或者減弱。如右圖所示,不同基因在不同發(fā)育階段表達量的變化:從幼蟲到成蟲,咽部基因的表達量一直在增加,會陰部基因只有蠕蟲發(fā)育成熟才開始表達;肛門肌肉基因的微弱表達也可用該方法檢測到。更多分析請參考:DuPuy, et al., Nature Biotechnology, 25, 663-338, 7 May 2007。
2.繪制斑馬魚側(cè)面熒光圖
基于參數(shù)峰值數(shù)量(Number of Peaks for each Parameter)進行分選。如下圖,一條四日齡、野生型斑馬魚軸向側(cè)面圖(被標(biāo)記紅色熒光)。
3.在水凝珠內(nèi)部生長的細胞簇
在細胞培養(yǎng)過程中,水凝珠作為細胞生長的基質(zhì),將細胞包裹在內(nèi)。COPAS以Peak Width作為細胞生長程度的依據(jù),分選出只含有單個細胞的水凝珠,進而得到來源單一的細胞簇。(Courtesy of S.Panke and M.Walser, ETH, Zurich.)
4.大鼠神經(jīng)干細胞的分選
利用PI染料標(biāo)記,分選大鼠神經(jīng)干細胞,如右圖:
5.在藥物篩選方面的新應(yīng)用
(1)結(jié)合分析,動力學(xué)與竟?fàn)幏治?/span>(BindingAssays, kinetics and competition assays)
使用COPAS生物分選系統(tǒng)在以微球為載體的化合物庫中篩選能與帶有熒光標(biāo)記的目標(biāo)蛋白結(jié)合的化合物,將陽性化合物微球加人微孔板以進行后續(xù)的MS,NMR及其它分析,將沒有結(jié)合蛋白的陰性化合物微球加人收集容器以便重復(fù)使用。另外,還可以根據(jù)熒光信號的強弱設(shè)定域值,將陽性化合物微球進一步分為結(jié)合能力不同的幾群。目前,已經(jīng)有科學(xué)家利用這種技術(shù)找到了一個能與纖維原細胞生長因子粘多糖結(jié)合位點結(jié)合的硫酸鹽化合物。
(2) On-bead酶一底物篩選(On-bead enzymesubstrate discovery)
將需要研究的多肽,如點突變多肽,兩端標(biāo)記上淬滅熒光基團(FRAP ),然后連接到微球上,從而建立一個以微球為載體的多肽庫。將多肽微球與目的蛋白酶結(jié)合,如果蛋白酶能夠切斷多肽,就會發(fā)出熒光信號。由于使用COPAS高速分選技術(shù),陽性微球可以被快速分選,以保證微球表面仍有足夠多的完整多肽以便進行后續(xù)分析。從建立多肽庫到陽性多肽序列分析的整個實驗流程,可以在一周內(nèi)完成,與傳統(tǒng)方法相比效率提高了一百倍。丹麥的一個研究小組已經(jīng)利用該技術(shù)研究了枯草桿菌蛋白酶的多肽底物結(jié)構(gòu)。
(3)蛋白酶抑制劑篩選
COPAS技術(shù)的一個更為復(fù)雜的應(yīng)用是在蛋白酶抑制劑篩選方面。首先,將帶有淬滅熒光基團(FRAP )的蛋白酶底物多膚連接在微球的一部分結(jié)合位點上,然后將需要篩選的抑制劑連接在微球的其它結(jié)合位點上,從而建立一個以微球為載體的抑制劑庫。將微球與蛋白酶一起孵育,如果抑制劑無效,蛋白酶會將多肽切斷,微球產(chǎn)生較強的熒光信號。如果抑制劑效果很強,蛋白酶無法切斷多肽,微球沒有熒光信號。如果抑制劑無法*抑制蛋白酶活性,那么仍會有部分多肽被切斷,微球會發(fā)出較弱的熒光信號。這樣就可以利用COPAS技術(shù)根據(jù)微球熒光信號的強弱對微球進行分選,從而快速找到不同抑制強度的抑制劑。這種技術(shù)在篩選抑制劑和優(yōu)化反應(yīng)條件方面具有很高的效率和很大的靈活性,可以實現(xiàn)每小時100000個化合物的高速篩選。利用這種技術(shù),荷蘭的一個研究小組在數(shù)周內(nèi)找到了*和多種基質(zhì)金屬蛋白酶的多種抑制劑。
綜上所述,COPAS大顆粒流式分選系統(tǒng)在大微粒分選方面的強大功能,必將為人類健康作出貢獻。
*,系統(tǒng)管路直徑增大以適應(yīng)10-1500um大小的生物微粒,這比普通流式細胞儀用于分選單個真核細胞的管路大的多。每一個COPAS大顆粒流式分選系統(tǒng)都針對不同尺寸范圍的微粒進行管路的優(yōu)化設(shè)計,以便在高速高通量分選時獲得的檢測靈敏度與準(zhǔn)確性。
第二,COPAS大顆粒流式分選系統(tǒng)技術(shù)的核心,即的氣流分選裝置(圖1、表1)。當(dāng)不需要收集時,分選系統(tǒng)會通過氣體將液流吹人廢液槽中;當(dāng)需要分選的微粒經(jīng)過時,分選系統(tǒng)會暫時將氣體分流器關(guān)閉,使氣流中斷,然后再重新打開分流器,這樣就能將含有待選微粒的液流噴人微孔板或收集容器中。這種分選的方式非常溫和,可以保證收集到的生物活體或敏感化學(xué)物質(zhì)的活性和完整性,對于后續(xù)的培養(yǎng)和分析不會產(chǎn)生任何負(fù)面影響,而普通流式細胞儀一般采用電磁場進行分選,會對生物活體產(chǎn)生致命的影響。
COPAS大顆粒流式分選系統(tǒng)可以同時檢測微粒的五種光學(xué)參數(shù),包括微粒的光密度(Extinction,EXT)、微粒的軸向長度(Time Of Flight,TOF ),以及三色熒光信號(表1)。樣本懸液在鞘液的包裹下形成層流,生物微粒被聚焦在液流的中心輸送到流動室,通過兩個低能激光器來激發(fā)和檢測光信號。其中,一個紅色激光器( 670nm)被用來檢測微粒的軸向長度和光密度,而另一個多色氫激光器(488/514nm)被用來激發(fā)多種熒光素。儀器的標(biāo)準(zhǔn)配置包括綠光、黃光及紅光檢測器,用來檢測受激發(fā)的熒光素發(fā)出的光信號。這些實時檢測的參數(shù)被用來將樣本中的微粒分群,只有那些符合用戶設(shè)定域值的微粒才會被分選系統(tǒng)加人微孔板或樣品收集容器中,而那些不在用戶設(shè)定域值范圍內(nèi)的微粒也可以被收集起來,以備后續(xù)的其它操作。zui終的分選速度取決于樣本的濃度和需要分選的微粒所占的百分比,zui快可以達到每小時100, 000個微粒。