潔凈室按照用途分類可分為兩類：
1、工業潔凈室
2、生物潔凈室；
按照氣流分類可分為四類：
1、單向流潔凈室
2、非單向流潔凈室
3、輻(矢)流潔凈室
4、混合流(局部單向流)潔凈室

潔凈室是指空氣潔凈度達到規定級別的可供人活動的空間，功能是控制微粒的污染。

為了達到規定的潔凈度級別，有效的控制微粒的污染，使人在其中從事精密的生產和科學實驗活動，潔凈室絕不是*于“潔凈”，而必須是一個對溫度、噪聲、照度、靜電、微振等都有相當要求的多功能的綜合整體，是集建筑裝飾、凈化空氣、純水純氣、電器控制等多種專業于一體的產物。

生物潔凈室的主要控制對象為有生命的微粒，分為一般生物潔凈室和生物學安全潔凈室。

1、一般生物潔凈室主要控制有生命微粒對工作對象的污染。同時其內部材料要能經受各種滅菌劑侵蝕，內部一般保持正壓。其實質上市結構和材料允許做滅菌處理的工業潔凈室，可用于食品工業（防止變質、生霉）、制藥工業（高純度、無菌制劑）、醫療設施（手術室、各種制劑室、調劑室）、動物實驗設施（無菌動物飼育）、實驗設施（理化、潔凈實驗室）。

2、生物學安全潔凈室，又稱生物安全實驗室，主要控制工作對象的有生命微粒對外界和對人的污染，內部保持負壓。用于實驗設施（細菌學、生物學潔凈實驗室）、生物工程（重組基因、疫苗制備）。