PlantScreen-SC植物表型分析測量系統(tǒng)(臺(tái)式)
一、用途
PlantScreen-SC植物表型分析測量系統(tǒng)具備植物RGB可見光彩色3D成像分析技術(shù)、葉綠素?zé)晒饧夹g(shù)。適于實(shí)驗(yàn)室或溫室作物表型成像分析研究,培養(yǎng)植物手動(dòng)放入系統(tǒng)內(nèi)載樣臺(tái)上(手動(dòng)載樣),載樣臺(tái)可360度旋轉(zhuǎn)以便對植物不同角度成像分析。可以得出植物、果實(shí)不同生育期的植株生長形態(tài)結(jié)構(gòu)參數(shù)、顏色分析、生長發(fā)育及生理功能參數(shù),如葉片形態(tài)測量、生長速率、植物生長結(jié)構(gòu)、葉綠素?zé)晒狻⒐夂舷到y(tǒng)運(yùn)作機(jī)理、色素組成、脅迫與抗性等,實(shí)現(xiàn)快速、高效率、無損傷測量檢測分析作物表型和生理生態(tài),從而篩選出株行優(yōu)良和抗逆性強(qiáng)的株系材料,加速作物育種進(jìn)程,是遺傳組學(xué)、表型組學(xué)、遺傳育種等研究的重要設(shè)備。
二、主要功能特點(diǎn):
?PlantScreen-SC為高通量PlantScreen植物表型分析平臺(tái)的Mini版本(又稱Bench-top版即臺(tái)式),RGB成像、葉綠素?zé)晒獾瘸上駛鞲衅髋渲迷谝粋€(gè)緊湊的箱體內(nèi),通過人工(代替自動(dòng)傳送帶)將植物樣品放置于箱體內(nèi)進(jìn)行成像分析,具有結(jié)構(gòu)簡單、緊湊,安裝使用方便(一般實(shí)驗(yàn)室或溫室都可安裝使用)、高性價(jià)比(省卻了昂貴復(fù)雜的傳送帶系統(tǒng)或XYZ三維移動(dòng)機(jī)械臂系統(tǒng))、功能全面等優(yōu)點(diǎn)。
?RGB 3D成像分析:包括頂部和側(cè)面高分辨率彩色成像,并配置有360°旋轉(zhuǎn)平臺(tái),可對植物進(jìn)行三維立體形態(tài)結(jié)構(gòu)和顏色分析測量,可用于植株、果實(shí)、種子等形態(tài)結(jié)構(gòu)和顏色分析及生長發(fā)育分析,包括大小(寬度、長度、面積等等)、緊密度、對稱性(偏心度、圓度、質(zhì)心等參數(shù))、顏色分析(綠度指數(shù)、葉病斑、果實(shí)成熟過程、真菌感染過程分析、不同顏色面積比率等)。通過葉綠素?zé)晒獗O(jiān)測模塊,還可以進(jìn)一步測量分析植物的光合效率、適合度、生物與非生物脅迫程度及敏感性,以及植物的抗逆性(如抗病、抗干旱等)等。
? 葉綠素?zé)晒獗O(jiān)測單元,通過無人值守自動(dòng)監(jiān)測即時(shí)葉綠素?zé)晒釬t、光量子產(chǎn)量QY、Kautsky誘導(dǎo)效應(yīng)、熒光淬滅、光響應(yīng)曲線,及OJIP快速熒光動(dòng)力學(xué)曲線等測量程序協(xié)議,監(jiān)測植物光合效率、適合度、光能利用效率、脅迫與抗性等生理性狀指標(biāo),用于植物生理生態(tài)功能、植物脅迫生理研究與抗性篩選。集成了PAM(脈沖調(diào)制技術(shù))熒光測量技術(shù)及OJIP快速熒光動(dòng)力學(xué)測量技術(shù)等*葉綠素?zé)晒饧夹g(shù)。可以得到包括 F0、Ft、Fm、Fm’、QY、QY_Ln、QY_Dn、NPQ、Qp、Rfd、PAR、Area、Mo、Sm、PI、ABS/RC 等50多個(gè)葉綠素?zé)晒鈪?shù)。
?環(huán)境因子監(jiān)測,同步監(jiān)測溫濕度與光合有效輻射等環(huán)境因子。
?PlantScreen表型大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。
三、組成:
主機(jī)箱;表型分析大數(shù)據(jù)平臺(tái),包括系統(tǒng)控制通訊軟件包、數(shù)據(jù)分析、服務(wù)器等,用于系統(tǒng)控制、數(shù)據(jù)采集分析等;三維RGB成像單元,包括頂部和側(cè)面兩個(gè)RGB鏡頭、旋轉(zhuǎn)植物樣品擱架;葉綠素?zé)晒鉁y量單元。
四、技術(shù)參數(shù):
1、主機(jī)系統(tǒng);
?具備智能LED冷白光源。
?內(nèi)置溫度、濕度及光強(qiáng)傳感器,用于同步監(jiān)測環(huán)境因子。
?360度旋轉(zhuǎn)平臺(tái)。
?PlantScreen表型服務(wù)器、PlantScreen 程序控制系統(tǒng)(Scheduler)。
?GUI(圖形用戶界面)實(shí)驗(yàn)設(shè)置與控制,實(shí)時(shí)顯示系統(tǒng)運(yùn)行狀態(tài)。
?支持多用戶注冊,個(gè)性化實(shí)驗(yàn)計(jì)劃、管理、存儲(chǔ)、顯示、分析。
?網(wǎng)絡(luò)化(Network):所有網(wǎng)絡(luò)組件符合1GBit標(biāo)準(zhǔn),主路由器提供系統(tǒng)內(nèi)網(wǎng)DHCP和路由服務(wù),還可與廠商服務(wù)器鏈接用于系統(tǒng)診斷、軟件更新等。
?主機(jī)系統(tǒng)(Main computer):Ryzen 5 3600 處理器,8GB RAM,256GB SSD 固態(tài)硬盤,6TB RAID5 存儲(chǔ),Windows 7 Pro 操作系統(tǒng),配套顯示器。
2.RGB 3D成像分析:
?5MP CMOS RGB成像鏡頭,傳感器尺寸1/2” 。
?分辨率2560x1920像素,像素大小2.2μm;幀頻:14fps@5MP。
?光學(xué)鏡頭:8mm SV0814H。
?視野: 55×55 cm。
?成像高度可調(diào)以適應(yīng)不通高度植物,植物大高度70cm(包括培養(yǎng)盆),冠幅不小于50cm。
?包括頂部和側(cè)面2個(gè)成像鏡頭和旋轉(zhuǎn)平臺(tái)(放置植物樣品),可各個(gè)角度成像測量分析,實(shí)現(xiàn)3D成像分析。
?可測量葉面積、葉周長、寬度等形態(tài)測量和生長分析,可進(jìn)行顏色分割分析等。
3.葉綠素?zé)晒獗O(jiān)測:
?集成了PAM(脈沖調(diào)制技術(shù))熒光測量技術(shù)及OJIP快速熒光動(dòng)力學(xué)測量技術(shù)等*葉綠素?zé)晒饧夹g(shù)。
?Protocols:可自動(dòng)運(yùn)行即時(shí)葉綠素?zé)晒釬t、光量子產(chǎn)量QY、Kautsky誘導(dǎo)效應(yīng)、2 套熒光淬滅、3 套光響應(yīng)曲線,及 OJIP-test 等近10 種測量程序協(xié)議(protocols)。
?測量參數(shù)達(dá)50余個(gè),其中OJIP-test在1秒時(shí)間內(nèi)測量記錄近多個(gè)葉綠素?zé)晒鈹?shù)據(jù)并通過軟件計(jì)算出包括 PI(Performance Index)等 26 個(gè)葉綠素?zé)晒鈪?shù)。
?測量光0-*可調(diào),脈沖調(diào)制0.01 - 0.09 µmol.m-2.s-1;光化光10 - 1000 µmol.m-2.s-1可調(diào)、飽和光脈沖10-*可調(diào)(可達(dá)3,000 µmol.m-2.s-1) 。
?數(shù)據(jù)通訊:USB或藍(lán)牙。
?具操作鍵和LC顯示屏。
4.形態(tài)分析測量參數(shù):
?葉面積(leaf area)
? 葉周長(leaf perimeter)
?偏心度(Eccentricity)
?圓度(roundness)
?直徑(circle diameter)
?平均葉寬指數(shù)(medium leaf width index)
?緊密度(solidity/compactness)
?凸包面積(convex hull area)
?質(zhì)心(centroid)
?葉或果實(shí)長、寬等各種形態(tài)結(jié)構(gòu)參數(shù)。
?時(shí)間序列分析以分析植物葉片果實(shí)生長率。
?整個(gè)生*或?qū)嶒?yàn)期葉面積比較分析等。
5.顏色分割分析測量
?綠度指數(shù)等。
?不同顏色面積比率等。
?顏色分割以進(jìn)行植物適合度評(píng)估等。
?葉片或果實(shí)顏色發(fā)育變化分析等,如果實(shí)形態(tài)發(fā)育與顏色發(fā)育過程變化等。
?顏色聚類分析。
6.葉綠素?zé)晒鉁y量參數(shù)
?測量參數(shù)包括F0、Ft、Fm、Fm’、QY、QY_Ln、QY_Dn、NPQ、Qp、Rfd、PAR、Area、Mo、Sm、PI、ABS/RC等50多個(gè)葉綠素?zé)晒鈪?shù),及3種給光程序的光響應(yīng)曲線、2種熒光淬滅曲線、OJIP曲線等。
?OJIP–test時(shí)間分辨率為10µs(每秒10萬次),給出OJIP曲線和26個(gè)參數(shù),包括F0、Fj、Fi、Fm、Fv、Vj、Vi、Fm/F0、Fv/F0、Fv/Fm、Mo、Area、Fix Area、Sm、Ss、N、Phi_Po、Psi_o、Phi_Eo、Phi–Do、Phi_Pav、PI_Abs、ABS/RC、TRo/RC、ETo/RC、DIo/RC等。
?內(nèi)置自動(dòng)運(yùn)行protocols:Ft、QY、OJIP、NPQ1、NPQ2、LC1、LC2、LC3等。
?系統(tǒng)具備自動(dòng)模式、手動(dòng)模式和服務(wù)器模式三種操作模式,自動(dòng)模式自動(dòng)運(yùn)行設(shè)定的程序,數(shù)據(jù)自動(dòng)處理并存入數(shù)據(jù)庫;手動(dòng)模式由人工啟動(dòng)程序;服務(wù)器模式用于系統(tǒng)校準(zhǔn)、快照、傳感器檢測、錯(cuò)誤報(bào)告等。
7.表型分析大數(shù)據(jù)平臺(tái)(服務(wù)器等)
?程序控制系統(tǒng)、表型分析系統(tǒng)(Plant DATA Analyzer)、應(yīng)用服務(wù)器、數(shù)據(jù)庫等。
?圖形用戶界面實(shí)驗(yàn)設(shè)置與控制,實(shí)時(shí)顯示系統(tǒng)運(yùn)行狀態(tài)。在線可視化(visualization)顯示實(shí)驗(yàn)過程、結(jié)果等。
五、產(chǎn)地
捷克
六、典型案例